Spansk påtalemyndighet kunngjorde anklagene 26. september etter at sangeren i fjor ble anklaget for å ha svindlet det spanske skattekontoret for €14,5 millioner ($15,3 millioner) i inntekt hun tjente mellom 2012 og 2014.
Shakira, hvis fulle navn er Shakira Isabel Mebarak Ripoll, skal stilles for rettssak i Barcelona 20. november på disse anklagene, men hun har nå blitt siktet for andre gang ettersom påtalemyndigheten hevder at hun unnlot å betale 6,7 millioner euro (7,1 millioner dollar) i skatt på inntekten hennes i 2018.
Spanske skattemyndigheter åpnet den siste saken mot Shakira i juli og bestemte seg for å reise tiltale etter å ha samlet bevis de siste to månedene.
I en uttalelse om anklagene sa Barcelonas påtalemyndighet at "Wherever, Whenever"-sangeren ble anklaget for å ha brukt et offshore-selskap basert i et skatteparadis for å unngå å betale skatt.
Shakira, som nå bor i Miami, Florida, har blitt varslet om påstandene, la uttalelsen til. Det er skrevet av Unilad .
PR-firmaet som tidligere har håndtert Shakiras saker, Llorente y Cuenca, hadde ingen umiddelbar kommentar, selv om det tidligere hevdet at Shakira «alltid hadde handlet i samsvar med loven og etter råd fra sine finansielle rådgivere».
Det er ikke satt noen dato for rettssak mot de nye anklagene.
Da Shakira først ble siktet i fjor, hevdet påtalemyndigheten i Barcelona at Grammy-vinneren tilbrakte mer enn halvparten av perioden 2012-14 i Spania og derfor burde ha betalt skatt i landet, selv om hennes offisielle residens var på Bahamas.
Sangerinnen har vært knyttet til Spania siden hun begynte å date den nå pensjonerte fotballspilleren Gerard Pique for 11 år siden.
Shakira og Pique deler to barn sammen og bodde sammen i Barcelona til i fjor da de bestemte seg for å gå hver til sitt.
Anklagene kommer ettersom skattemyndighetene i Spania fortsetter å slå ned på skatter.
I løpet av det siste tiåret har myndighetene rettet oppmerksomheten mot fotballstjerner som Lionel Messi og Cristiano Ronaldo for ikke å betale hele avgiften i skatt.
Begge kjente fotballspillere ble funnet skyldige i skatteunndragelse, men klarte å unngå fengselsstraff takket være en bestemmelse som lar en dommer frafalle straffer på mindre enn to år for førstegangsforbrytere.
Shakira risikerer opptil åtte års fengsel pluss en stor bot hvis hun blir dømt under rettssaken mot de første anklagene, noe som betyr at hun kan risikere en større straff som følge av de nylig tilføyde anklagene.