Streiken forventes å påvirke flytrafikken i Berlin, München, Düsseldorf og i hovedtrafikken Frankfurt.
Dette skriver nyhetsbyrået Reuters.
Transportsektoren i Tyskland har vært hardt rammet av kanselleringer på grunn av streikende ansatte den siste uken. Sist uke streiket sikkerhetspersonell i flere store tyske byer.
Det gjorde at flere hundre avganger ble kansellert bare i Frankfurt.
Lufthansa kan foreløpig ikke si hvor mange av de opptil 3000 avgangene som vil bli berørt av streiken onsdag, som starter onsdag morgen og forventes å avsluttes omtrent et døgn senere, tidlig torsdag.
Fagforbundet Verdi stilte seg bak de ansatte i forrige uke og i den kommende streiken.
De rundt 25.000 flyplassoperatørene krever en lønnsøkning på 12,5 prosent, og en engangsbetaling på 3.000 euro for å kompensere for fjorårets inflasjon.
I slutten av januar viste også det tyske togpersonalet sin misnøye med både lønn og arbeidstid ved å gjennomføre en fem dager lang streik, som i stor grad lammet togtrafikken .