Men nå kan en av hemmelighetene ha blitt avslørt.
Ann Pizzorusso, som er geolog og kunsthistoriker med spesialisering i Leonardo da Vinci og renessansen, mener hun har funnet et svar på hva bakgrunnen til maleriet representerer.
"I notatboken nevner han å være i Lecco," sier hun til CNN .
Lecco ligger på den sørøstlige bredden av Comosjøen i Italia
Ifølge Pizzorusso kan Leccos unike fjellformasjon sees i horisonten i maleriet av Mona Lisa, mens vannmassen representerer Comosjøen.
Pizzorusso har «gjemt» hemmeligheten i 30 år, men da hun kom tilbake til Lecco denne uken, var hun ikke i tvil om at alt stemte.
Derfor vil hun presentere funnene sine på en geologikonferanse i byen.
Den mulige avklaringen av plasseringen fører til et nytt spørsmål om Leonardo da Vincis verdensberømte kunstverk.
– Vi vet ikke hvem Mona Lisa er, men noen mener hun var en rik toskansk handelskone, sier Pizzorusso og viser til en populær historisk teori om at personen i maleriet var basert på den italienske adelskvinnen Lisa Gherardini.
«Hvorfor plasserte han henne i dette ville, utemmede miljøet? Dette er ikke Toscana. Hva prøvde han å fortelle oss ved å plassere denne rolige, gåtefulle damen i dette harde, alpine miljøet? Jeg er veldig spent på å se hva budskapet hans til oss var.