53 år gamle Vadim Zimin, er for tiden innlagt på sykehus og kjemper for sitt liv.
Obersten, som var svært hemmelighetsfull, ble siktet for bestikkelser etter å ha vært ansatt i tollen, og var i husarrest da hendelsen fant sted.
Zimin var tidligere ansvarlig for å bære kofferten, som antas å inneholde kodene til Russlands atomvåpenarsenal, og som alltid følger Putin - selv om han ikke var den eneste som var ansvarlig for å utføre denne oppgaven.
Han hadde også denne rollen i løpet av Putins forgjenger Boris Jeltsin, men det eksakte omfanget av hans rolle i administrasjonen er fortsatt uklart, og det er angivelig bare ett bilde av ham.
Zimin skal ha blitt funnet med flere skuddsår på kjøkkenet i leiligheten sin i utkanten av Moskva.
Han var angivelig alene hjemme under skytingen da kona hans, som er lege, behandler soldater som hadde kommet hjem såret fra krigen i Ukraina.
Foto: East2West News
Den hemmelige mappen som han var ansvarlig for å bære, kjent som "Cheget" i Russland, antas å inneholde avfyringskodene til Kremls atomvåpenarsenal.
Den har sin egen nøkkelkode og er under nøye overvåking døgnet rundt.
Putin, som er kjent for å nyte å "spotte" Vesten, bruker også kofferten som et symbol.
Han "spotter" Vesten ved alltid å holde mappen synlig - selv på offisielle arrangementer.
Han hadde det med seg i april, da han deltok i begravelsen til den ultranasjonalistiske Vladimir Zhirinovsky - og her ble den holdt nær kroppen.
Putin mistet i går en annen oberst hvis helikopter ble truffet av en ukrainsk rakett.
Oberstløytnant Sergey Gundoro, 51, sies å være den 55. Officier i samme rang som har blitt drept under den russiske innovasjonen av Ukraina.